Ближние пещеры изначально состояли из трех улиц, связанных между собой переходами. Главной является Пещерная улица, к которой примыкает церковь Введение Богородицы в Храм — самая древняя в Ближних пещерах.
Вследствие более поздних перестроек проходы Ближних пещер утратили первоначальные размеры. Теперь их ширина достигает 1,5 м, высота — 2,5 м. Общая длина подземных коридоров Ближних пещер составляет 383 м.