За роки свого існування, а початок музей веде, як стверджують його співробітники, із зоологічного кабінету Волинського ліцею у м. Кремeнці, відкритого 1805 р., кому тільки не підпорядковувалися та не належали його експонати, то збираючись до купи, то знову зникаючи у небуття. Під час Першої світової війни, 1915 р., музей було евакуйовано до Саратова, потім передано до Київського інституту освіти. І лише в 1933 р. повернуто Київському університету. На 1941 р. колекції зоологічного музею Київського державного університету ім. Т.Г. Шевченка, надбані копіткою працею українських, російських, польських учених, серед яких було багато вихідців із Німеччини, налічували понад 2,5 млн одиниць зберігання. Однак музей не було евакуйовано, і він постраждав при визволенні міста в 1943-му. Та завдяки самовідданості й самопожертві ентузіастів, що працювали і працюють тут, музей вижив, поповнився новими експонатами, перетворився на об’єднавчий центр просвіти, наукової творчості та громадської активності вчених – і знову запрошує відвідувачів.